АМИ был основана в 1990 году. Это первый частный медицинский университет на постсоветском пространстве. Он был аккредитован государством в 2001 году.
В Институте работают около 150 высококвалифицированных специалистов, докторов наук, профессоров, кандидатов наук и доцентов. Этот мощный научный потенциал играет серьезную роль в развитии медицины Армении. В АМИ есть 20 кафедр, которые расположены на территории собственного здания и 25 клинических базах, которые являются ведущими медицинскими центрами в Республике. Клиническая больница «Эребуни» является основной образовательной и производственной базой института, где студенты получают ценные знания и практические навыки . Больница предоставляет студентам опыт работы в клиниках, поликлиниках, лабораториях и диагностических центрах. В АМИ есть два факультета:
В 2015 году исполнилось 25 лет деятельности АМИ. За прошедшие годы институт подготовил и обучил несколько поколений врачей, которые проявили себя в нашей стране и за рубежом. Многие выпускники института защитили кандидатскую диссертацию. Некоторые из них преподают в своем родном ВУЗе. У АМИ есть студенческий совет, который представляет студенческие проблемы.
АМИ ежемесячно публикует газету «Еребуни», целью которои является освещение жизни и событий института. Основным органом института является совет директоров. Институт управляется ректором. Факультет администрируется деканами. Институт имеет центр обеспечения качества образования. Научно- педагогическая работа контролируется ученым советом Института. АМИ стремится реализовать передовые образовательные программы и методы для формирования здоровой морально-психологической атмосферы.